Bakkergistcellen zijn qua organisatie goed te vergelijken met onze eigen cellen, en zijn daarom een nuttig studie-object als het gaat om fundamentele vragen over de organisatie van DNA in de celkern en hoe dit genregulatie beïnvloedt. De chromatine-structuur is de moleculaire basis van epigenetische informatie. Philipp bestudeert veranderingen in het chromatine na in- of uitschakeling van genen in gist. Om de onderliggende biochemische mechanismen te begrijpen kijkt hij niet alleen wat er gebeurt in levende gistcellen, maar werkt hij ook aan de wederopbouw van chromatine-structuren en -dynamica vanuit afzonderlijke onderdelen.