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Come in altri organismi, il DNA delle cellule del lievito è strettamente condensato dalle proteine istoniche in una struttura chiamata cromatina. Alterando la struttura della cromatina mediante modifiche chimiche del DNA o degli istoni è possibile determinare quali geni vengono attivati e quali disattivati. Queste alterazioni potranno in seguito essere trasmesse alle nuove cellule anche se il loro codice genetico non varia, e sono pertanto da ritenersi modifiche di natura epigenetica. Se avvengono in modo inopportuno, le modifiche epigenetiche possono causare il cancro negli esseri umani. Fred utilizza il lievito da fornaio come organismo modello per studiare queste modifiche epigenetiche e ha identificato una proteina, chiamata DOT1, in grado di modificare chimicamente gli istoni tramite metilazione, silenziando così dei geni.