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Maarten studia le proteine dei fattori di trascrizione del gruppo Polycomb. Le proteine del gruppo Polycomb regolano i geni Hox, i quali devono essere attivati o disattivati al momento e nel luogo giusti perché gli esseri umani e altri organismi si sviluppino correttamente. Il gruppo di ricerca di Maarten ha dimostrato che le proteine del gruppo Polycomb sono essenziali in cellule particolari, le cellule staminali, necessarie per reintegrare le cellule di tutti i nostri organi. Se le proteine del gruppo Polycomb non sono regolate adeguatamente, possono insorgere anomalie dello sviluppo e le cellule staminali possono proliferare in maniera aberrante. Maarten sta inoltre tentando di identificare proteine definite oncosoppressori.