Maarten travaille sur le groupe de protéines facteurs de transcription Polycomb. Les protéines du groupe Polycomb régulent les gènes Hox, qui doivent être activés ou désactivés au bon moment et au bon endroit pour que les humains, entre autres organismes, se développent correctement. L’équipe de Maarten a montré que les protéines du groupe Polycomb sont essentielles dans ces cellules spéciales appelées cellules souches, nécessaires au remplacement des cellules de tous nos organes. Si les protéines du groupe Polycomb ne sont pas bien régulées, il peut en résulter des anomalies congénitales et une prolifération aberrante des cellules souches. Maarten essaye également d’identifier des protéines appelées suppresseurs de tumeurs.