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En un momento dado, sólo un subconjunto de nuestros ~22.000 genes está activado y el resto está silenciado. Para que un gen esté silenciado, su cromosoma o ambiente cromatínico debe estar en estado silencioso. Una forma de generar estados de cromatina silenciosos es por deacetilación de las proteínas histónicas, una modificación química de las proteínas que se unen al ADN de los cromosomas. Otra forma es silenciar los genes utilizando pequeñas moléculas de ARN en un proceso llamado interferencia de ARN. Karl está intentando crear un mapa de todo el genoma que muestre dónde existen marcas de acetilación y pequeñas moléculas de ARN para ver cómo éstas afectan a la actividad génica.