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Maarten estudia el grupo Polycomb de factores (proteínas) de transcripción. Las proteínas del grupo Polycomb regulan a los genes Hox, que deben ser activados o desactivados en el momento y lugar apropiado para que los humanos y otros organismos se desarrollen de forma correcta. El grupo de investigación de Maarten ha mostrado que las proteínas del grupo Polycomb son fundamentales en las células especiales llamadas células madre, necesarias para reponer células en todos nuestros órganos. Si las proteínas del grupo Polycomb no son reguladas de forma apropiada, se pueden producir anomalías en el desarrollo y una proliferación aberrante de células madre. También está intentando identificar otro tipo de proteínas llamadas supresores de tumores.