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El proceso activo de expresión de los genes, conocido como transcripción, no ocurre de forma homogénea en todo el núcleo celular, sino en regiones discretas llamadas factorías de transcripción. Estos sitios son muy ricos en enzimas especializadas y complejos proteicos necesarios para activar los genes. La investigación de Peter ha mostrado que múltiples genes pueden compartir la misma factoría de transcripción y apunta a que los genes individuales están continuamente moviéndose dentro y fuera de estos sitios, activándose y desactivándose simultáneamente. Peter ha estado estudiando cómo los genes y los elementos reguladores distales interaccionan y cómo estos complejos captan otros complejos génicos en las factorías de transcripción.