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Zu ein und demselben Zeitpunkt ist immer nur eine Untergruppe unserer rund 22.000 Gene angeschaltet; der Rest ist inaktiv. Für die Stilllegung eines Gens muss seine chromosomale oder Chromatin-Umgebung sich in einem stillen Zustand befinden. Ein Weg zur Erzeugung stiller Chromatinzustände ist die Deacetylierung von Histonproteinen, eine chemische Modifikation von Proteinen, die sich an die chromosomale DNA binden. Ein zweiter Weg ist das Silencing von Genen mit Hilfe kleiner RNA-Moleküle in einem Prozess, der RNA-Interferenz genannt wird. Karl versucht, eine Karte des gesamten Genoms zu erstellen, die zeigt, wo Acetylierungsmarkierungen und kleine RNA-Moleküle vorkommen, um zu erkennen, wie sie sich auf die Genaktivität auswirken.